| 1. Sekretariat Jenderal |
| 2. Inspektorat Jenderal |
| 3. Direktorat Jenderal Pendidikan Islam |
| 4. Direktorat Jenderal Penyelenggaraan Haji dan Umrah |
| 5. Direktorat Jenderal Bimas Islam |
| 6. Direktorat Jenderal Bimas Kristen |
| 7. Direktorat Jenderal Bimas Katolik |
| 8. Direktorat Jenderal Bimas Hindu |
| 9. Direktorat Jenderal Bimas Buddha |
| 10. Badan Litbang dan Diklat |
| 11. Badan Penyelenggara Jaminan Produk Halal |
