1. Sekretariat Jenderal |
2. Inspektorat Jenderal |
3. Direktorat Jenderal Pendidikan Islam |
4. Direktorat Jenderal Penyelenggaraan Haji dan Umrah |
5. Direktorat Jenderal Bimas Islam |
6. Direktorat Jenderal Bimas Kristen |
7. Direktorat Jenderal Bimas Katolik |
8. Direktorat Jenderal Bimas Hindu |
9. Direktorat Jenderal Bimas Buddha |
10. Badan Litbang dan Diklat |
11. Badan Penyelenggara Jaminan Produk Halal |